Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNRC6BQ9UPQ9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNRC6BQ9UPQ9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNRC6BQ9UPQ9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNRC6BQ9UPQ9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNRC6BQ9UPQ9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNRC6BQ9UPQ9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNRC6BQ9UPQ9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNRC6BQ9UPQ9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNRC6BQ9UPQ9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNRC6BQ9UPQ9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNRC6BQ9UPQ9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNRC6BQ9UPQ9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNRC6BQ9UPQ9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNRC6BQ9UPQ9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNRC6BQ9UPQ9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNRC6BQ9UPQ9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNRC6BQ9UPQ9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNRC6BQ9UPQ9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNRC6BQ9UPQ9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNRC6BQ9UPQ9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNRC6BQ9UPQ9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNRC6BQ9UPQ9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNRC6BQ9UPQ9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNRC6BQ9UPQ9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNRC6BQ9UPQ9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNRC6BQ9UPQ9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNRC6BQ9UPQ9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNRC6BQ9UPQ9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNRC6BQ9UPQ9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNRC6BQ9UPQ9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TNRC6BQ9UPQ9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNRC6BQ9UPQ9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNRC6BQ9UPQ9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNRC6BQ9UPQ9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC6BQ9UPQ9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC6BQ9UPQ9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNRC6BQ9UPQ9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNRC6BQ9UPQ9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TNRC6BQ9UPQ9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNRC6BQ9UPQ9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TNRC6BQ9UPQ9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC6BQ9UPQ9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC6BQ9UPQ9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC6BQ9UPQ9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC6BQ9UPQ9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC6BQ9UPQ9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNRC6BQ9UPQ9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNRC6BQ9UPQ9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNRC6BQ9UPQ9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNRC6BQ9UPQ9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNRC6BQ9UPQ9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNRC6BQ9UPQ9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNRC6BQ9UPQ9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNRC6BQ9UPQ9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNRC6BQ9UPQ9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TNRC6BQ9UPQ9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNRC6BQ9UPQ9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNRC6BQ9UPQ9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNRC6BQ9UPQ9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNRC6BQ9UPQ9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms