Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX6Q9UPM6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX6Q9UPM6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX6Q9UPM6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX6Q9UPM6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX6Q9UPM6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX6Q9UPM6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX6Q9UPM6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX6Q9UPM6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX6Q9UPM6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX6Q9UPM6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX6Q9UPM6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX6Q9UPM6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX6Q9UPM6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX6Q9UPM6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX6Q9UPM6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHX6Q9UPM6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHX6Q9UPM6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX6Q9UPM6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX6Q9UPM6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX6Q9UPM6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX6Q9UPM6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHX6Q9UPM6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHX6Q9UPM6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHX6Q9UPM6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHX6Q9UPM6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHX6Q9UPM6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX6Q9UPM6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX6Q9UPM6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX6Q9UPM6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX6Q9UPM6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX6Q9UPM6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX6Q9UPM6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX6Q9UPM6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX6Q9UPM6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX6Q9UPM6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX6Q9UPM6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX6Q9UPM6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX6Q9UPM6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX6Q9UPM6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX6Q9UPM6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX6Q9UPM6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX6Q9UPM6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX6Q9UPM6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX6Q9UPM6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX6Q9UPM6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX6Q9UPM6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX6Q9UPM6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX6Q9UPM6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX6Q9UPM6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LHX6Q9UPM6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms