Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC12A4Q9UP95 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC12A4Q9UP95 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC12A4Q9UP95 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC12A4Q9UP95 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC12A4Q9UP95 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC12A4Q9UP95 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC12A4Q9UP95 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC12A4Q9UP95 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC12A4Q9UP95 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC12A4Q9UP95 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC12A4Q9UP95 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC12A4Q9UP95 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC12A4Q9UP95 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC12A4Q9UP95 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC12A4Q9UP95 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC12A4Q9UP95 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC12A4Q9UP95 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC12A4Q9UP95 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC12A4Q9UP95 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC12A4Q9UP95 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC12A4Q9UP95 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC12A4Q9UP95 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC12A4Q9UP95 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC12A4Q9UP95 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC12A4Q9UP95 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC12A4Q9UP95 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC12A4Q9UP95 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC12A4Q9UP95 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC12A4Q9UP95 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC12A4Q9UP95 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC12A4Q9UP95 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC12A4Q9UP95 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC12A4Q9UP95 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC12A4Q9UP95 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC12A4Q9UP95 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC12A4Q9UP95 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC12A4Q9UP95 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC12A4Q9UP95 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC12A4Q9UP95 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC12A4Q9UP95 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC12A4Q9UP95 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC12A4Q9UP95 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC12A4Q9UP95 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC12A4Q9UP95 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC12A4Q9UP95 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC12A4Q9UP95 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC12A4Q9UP95 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC12A4Q9UP95 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC12A4Q9UP95 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC12A4Q9UP95 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC12A4Q9UP95 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC12A4Q9UP95 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms