Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL4

ING4, Inhibitor of growth protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ING4Q9UNL4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ING4Q9UNL4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ING4Q9UNL4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ING4Q9UNL4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ING4Q9UNL4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ING4Q9UNL4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ING4Q9UNL4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ING4Q9UNL4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ING4Q9UNL4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ING4Q9UNL4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ING4Q9UNL4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ING4Q9UNL4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ING4Q9UNL4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ING4Q9UNL4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ING4Q9UNL4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ING4Q9UNL4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ING4Q9UNL4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ING4Q9UNL4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ING4Q9UNL4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ING4Q9UNL4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ING4Q9UNL4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ING4Q9UNL4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ING4Q9UNL4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ING4Q9UNL4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ING4Q9UNL4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ING4Q9UNL4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ING4Q9UNL4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ING4Q9UNL4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ING4Q9UNL4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ING4Q9UNL4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ING4Q9UNL4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ING4Q9UNL4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ING4Q9UNL4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ING4Q9UNL4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ING4Q9UNL4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ING4Q9UNL4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ING4Q9UNL4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ING4Q9UNL4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ING4Q9UNL4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ING4Q9UNL4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ING4Q9UNL4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ING4Q9UNL4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ING4Q9UNL4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ING4Q9UNL4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ING4Q9UNL4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ING4Q9UNL4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ING4Q9UNL4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ING4Q9UNL4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ING4Q9UNL4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ING4Q9UNL4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms