Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZMYND8Q9ULU4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZMYND8Q9ULU4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZMYND8Q9ULU4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZMYND8Q9ULU4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZMYND8Q9ULU4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZMYND8Q9ULU4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZMYND8Q9ULU4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZMYND8Q9ULU4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ZMYND8Q9ULU4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZMYND8Q9ULU4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZMYND8Q9ULU4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZMYND8Q9ULU4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZMYND8Q9ULU4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZMYND8Q9ULU4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZMYND8Q9ULU4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZMYND8Q9ULU4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZMYND8Q9ULU4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZMYND8Q9ULU4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZMYND8Q9ULU4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZMYND8Q9ULU4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ZMYND8Q9ULU4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZMYND8Q9ULU4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ZMYND8Q9ULU4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZMYND8Q9ULU4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZMYND8Q9ULU4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZMYND8Q9ULU4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZMYND8Q9ULU4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZMYND8Q9ULU4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ZMYND8Q9ULU4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZMYND8Q9ULU4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZMYND8Q9ULU4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ZMYND8Q9ULU4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZMYND8Q9ULU4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZMYND8Q9ULU4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ZMYND8Q9ULU4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZMYND8Q9ULU4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZMYND8Q9ULU4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZMYND8Q9ULU4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZMYND8Q9ULU4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZMYND8Q9ULU4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ZMYND8Q9ULU4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZMYND8Q9ULU4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZMYND8Q9ULU4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ZMYND8Q9ULU4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZMYND8Q9ULU4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZMYND8Q9ULU4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZMYND8Q9ULU4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZMYND8Q9ULU4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZMYND8Q9ULU4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZMYND8Q9ULU4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZMYND8Q9ULU4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZMYND8Q9ULU4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZMYND8Q9ULU4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZMYND8Q9ULU4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZMYND8Q9ULU4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZMYND8Q9ULU4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZMYND8Q9ULU4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZMYND8Q9ULU4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ZMYND8Q9ULU4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZMYND8Q9ULU4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZMYND8Q9ULU4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZMYND8Q9ULU4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ZMYND8Q9ULU4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZMYND8Q9ULU4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZMYND8Q9ULU4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZMYND8Q9ULU4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZMYND8Q9ULU4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZMYND8Q9ULU4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZMYND8Q9ULU4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZMYND8Q9ULU4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZMYND8Q9ULU4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZMYND8Q9ULU4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZMYND8Q9ULU4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZMYND8Q9ULU4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZMYND8Q9ULU4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZMYND8Q9ULU4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZMYND8Q9ULU4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZMYND8Q9ULU4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZMYND8Q9ULU4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZMYND8Q9ULU4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZMYND8Q9ULU4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZMYND8Q9ULU4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZMYND8Q9ULU4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZMYND8Q9ULU4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZMYND8Q9ULU4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZMYND8Q9ULU4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZMYND8Q9ULU4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZMYND8Q9ULU4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZMYND8Q9ULU4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZMYND8Q9ULU4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZMYND8Q9ULU4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZMYND8Q9ULU4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZMYND8Q9ULU4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZMYND8Q9ULU4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZMYND8Q9ULU4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ZMYND8Q9ULU4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZMYND8Q9ULU4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZMYND8Q9ULU4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZMYND8Q9ULU4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms