Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL25

RAB21, Ras-related protein Rab-21, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB21Q9UL25 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB21Q9UL25 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB21Q9UL25 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB21Q9UL25 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB21Q9UL25 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB21Q9UL25 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB21Q9UL25 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB21Q9UL25 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB21Q9UL25 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB21Q9UL25 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB21Q9UL25 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB21Q9UL25 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB21Q9UL25 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB21Q9UL25 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB21Q9UL25 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB21Q9UL25 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB21Q9UL25 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB21Q9UL25 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB21Q9UL25 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB21Q9UL25 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB21Q9UL25 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB21Q9UL25 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB21Q9UL25 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB21Q9UL25 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB21Q9UL25 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB21Q9UL25 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB21Q9UL25 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB21Q9UL25 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
RAB21Q9UL25 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
RAB21Q9UL25 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB21Q9UL25 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB21Q9UL25 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB21Q9UL25 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB21Q9UL25 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB21Q9UL25 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB21Q9UL25 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB21Q9UL25 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB21Q9UL25 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB21Q9UL25 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB21Q9UL25 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB21Q9UL25 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB21Q9UL25 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB21Q9UL25 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB21Q9UL25 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB21Q9UL25 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB21Q9UL25 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB21Q9UL25 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB21Q9UL25 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB21Q9UL25 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB21Q9UL25 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB21Q9UL25 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB21Q9UL25 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB21Q9UL25 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB21Q9UL25 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB21Q9UL25 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB21Q9UL25 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB21Q9UL25 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB21Q9UL25 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB21Q9UL25 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB21Q9UL25 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB21Q9UL25 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB21Q9UL25 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB21Q9UL25 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB21Q9UL25 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB21Q9UL25 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB21Q9UL25 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB21Q9UL25 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB21Q9UL25 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB21Q9UL25 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB21Q9UL25 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB21Q9UL25 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB21Q9UL25 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB21Q9UL25 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB21Q9UL25 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB21Q9UL25 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB21Q9UL25 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB21Q9UL25 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB21Q9UL25 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB21Q9UL25 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB21Q9UL25 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB21Q9UL25 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB21Q9UL25 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB21Q9UL25 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB21Q9UL25 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB21Q9UL25 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB21Q9UL25 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB21Q9UL25 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB21Q9UL25 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB21Q9UL25 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB21Q9UL25 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB21Q9UL25 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB21Q9UL25 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB21Q9UL25 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAB21Q9UL25 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAB21Q9UL25 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB21Q9UL25 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB21Q9UL25 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB21Q9UL25 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB21Q9UL25 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB21Q9UL25 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms