Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SARDHQ9UL12 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SARDHQ9UL12 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SARDHQ9UL12 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms