Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PRDM4Q9UKN5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRDM4Q9UKN5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRDM4Q9UKN5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM4Q9UKN5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM4Q9UKN5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM4Q9UKN5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM4Q9UKN5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM4Q9UKN5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM4Q9UKN5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM4Q9UKN5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM4Q9UKN5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM4Q9UKN5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM4Q9UKN5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM4Q9UKN5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM4Q9UKN5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM4Q9UKN5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM4Q9UKN5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM4Q9UKN5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM4Q9UKN5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM4Q9UKN5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM4Q9UKN5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM4Q9UKN5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM4Q9UKN5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM4Q9UKN5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM4Q9UKN5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM4Q9UKN5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM4Q9UKN5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM4Q9UKN5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM4Q9UKN5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM4Q9UKN5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM4Q9UKN5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM4Q9UKN5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM4Q9UKN5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM4Q9UKN5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM4Q9UKN5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM4Q9UKN5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM4Q9UKN5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM4Q9UKN5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM4Q9UKN5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM4Q9UKN5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM4Q9UKN5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM4Q9UKN5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM4Q9UKN5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM4Q9UKN5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM4Q9UKN5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM4Q9UKN5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM4Q9UKN5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM4Q9UKN5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM4Q9UKN5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM4Q9UKN5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM4Q9UKN5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM4Q9UKN5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM4Q9UKN5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms