Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SWAP70Q9UH65 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SWAP70Q9UH65 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SWAP70Q9UH65 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SWAP70Q9UH65 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SWAP70Q9UH65 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SWAP70Q9UH65 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SWAP70Q9UH65 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SWAP70Q9UH65 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SWAP70Q9UH65 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SWAP70Q9UH65 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SWAP70Q9UH65 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SWAP70Q9UH65 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SWAP70Q9UH65 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SWAP70Q9UH65 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SWAP70Q9UH65 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SWAP70Q9UH65 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SWAP70Q9UH65 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SWAP70Q9UH65 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SWAP70Q9UH65 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SWAP70Q9UH65 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SWAP70Q9UH65 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SWAP70Q9UH65 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SWAP70Q9UH65 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SWAP70Q9UH65 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SWAP70Q9UH65 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SWAP70Q9UH65 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SWAP70Q9UH65 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SWAP70Q9UH65 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SWAP70Q9UH65 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SWAP70Q9UH65 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SWAP70Q9UH65 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SWAP70Q9UH65 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SWAP70Q9UH65 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SWAP70Q9UH65 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SWAP70Q9UH65 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SWAP70Q9UH65 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SWAP70Q9UH65 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SWAP70Q9UH65 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SWAP70Q9UH65 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SWAP70Q9UH65 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SWAP70Q9UH65 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SWAP70Q9UH65 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SWAP70Q9UH65 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SWAP70Q9UH65 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SWAP70Q9UH65 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SWAP70Q9UH65 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SWAP70Q9UH65 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SWAP70Q9UH65 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SWAP70Q9UH65 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SWAP70Q9UH65 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SWAP70Q9UH65 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SWAP70Q9UH65 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SWAP70Q9UH65 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SWAP70Q9UH65 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SWAP70Q9UH65 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SWAP70Q9UH65 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SWAP70Q9UH65 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SWAP70Q9UH65 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SWAP70Q9UH65 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SWAP70Q9UH65 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SWAP70Q9UH65 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SWAP70Q9UH65 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SWAP70Q9UH65 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SWAP70Q9UH65 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms