Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ5

EIF3K, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3KQ9UBQ5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
EIF3KQ9UBQ5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3KQ9UBQ5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3KQ9UBQ5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3KQ9UBQ5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3KQ9UBQ5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3KQ9UBQ5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3KQ9UBQ5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3KQ9UBQ5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3KQ9UBQ5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3KQ9UBQ5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF3KQ9UBQ5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF3KQ9UBQ5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF3KQ9UBQ5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF3KQ9UBQ5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF3KQ9UBQ5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3KQ9UBQ5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3KQ9UBQ5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3KQ9UBQ5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3KQ9UBQ5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF3KQ9UBQ5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF3KQ9UBQ5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF3KQ9UBQ5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF3KQ9UBQ5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF3KQ9UBQ5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF3KQ9UBQ5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF3KQ9UBQ5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF3KQ9UBQ5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF3KQ9UBQ5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF3KQ9UBQ5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF3KQ9UBQ5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EIF3KQ9UBQ5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EIF3KQ9UBQ5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3KQ9UBQ5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms