Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SPASTQ9UBP0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPASTQ9UBP0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPASTQ9UBP0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPASTQ9UBP0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SPASTQ9UBP0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPASTQ9UBP0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPASTQ9UBP0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPASTQ9UBP0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPASTQ9UBP0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPASTQ9UBP0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPASTQ9UBP0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SPASTQ9UBP0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPASTQ9UBP0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPASTQ9UBP0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPASTQ9UBP0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPASTQ9UBP0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPASTQ9UBP0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPASTQ9UBP0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPASTQ9UBP0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPASTQ9UBP0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPASTQ9UBP0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPASTQ9UBP0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPASTQ9UBP0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPASTQ9UBP0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPASTQ9UBP0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPASTQ9UBP0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPASTQ9UBP0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPASTQ9UBP0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPASTQ9UBP0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPASTQ9UBP0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPASTQ9UBP0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPASTQ9UBP0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SPASTQ9UBP0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPASTQ9UBP0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPASTQ9UBP0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPASTQ9UBP0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPASTQ9UBP0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPASTQ9UBP0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPASTQ9UBP0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPASTQ9UBP0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPASTQ9UBP0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SPASTQ9UBP0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPASTQ9UBP0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPASTQ9UBP0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPASTQ9UBP0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPASTQ9UBP0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPASTQ9UBP0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPASTQ9UBP0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPASTQ9UBP0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPASTQ9UBP0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPASTQ9UBP0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPASTQ9UBP0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPASTQ9UBP0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPASTQ9UBP0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPASTQ9UBP0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SPASTQ9UBP0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPASTQ9UBP0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPASTQ9UBP0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms