Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC17A6Q9P2U8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC17A6Q9P2U8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC17A6Q9P2U8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms