Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N5

RBM27, RNA-binding protein 27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM27Q9P2N5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RBM27Q9P2N5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RBM27Q9P2N5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RBM27Q9P2N5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBM27Q9P2N5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBM27Q9P2N5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBM27Q9P2N5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBM27Q9P2N5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBM27Q9P2N5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBM27Q9P2N5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RBM27Q9P2N5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RBM27Q9P2N5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RBM27Q9P2N5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RBM27Q9P2N5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RBM27Q9P2N5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RBM27Q9P2N5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RBM27Q9P2N5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RBM27Q9P2N5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RBM27Q9P2N5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RBM27Q9P2N5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RBM27Q9P2N5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RBM27Q9P2N5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RBM27Q9P2N5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RBM27Q9P2N5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RBM27Q9P2N5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RBM27Q9P2N5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RBM27Q9P2N5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RBM27Q9P2N5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RBM27Q9P2N5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RBM27Q9P2N5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RBM27Q9P2N5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RBM27Q9P2N5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RBM27Q9P2N5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RBM27Q9P2N5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RBM27Q9P2N5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RBM27Q9P2N5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RBM27Q9P2N5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RBM27Q9P2N5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RBM27Q9P2N5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RBM27Q9P2N5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RBM27Q9P2N5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RBM27Q9P2N5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RBM27Q9P2N5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RBM27Q9P2N5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RBM27Q9P2N5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RBM27Q9P2N5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RBM27Q9P2N5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RBM27Q9P2N5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RBM27Q9P2N5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RBM27Q9P2N5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RBM27Q9P2N5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RBM27Q9P2N5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RBM27Q9P2N5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RBM27Q9P2N5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RBM27Q9P2N5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RBM27Q9P2N5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RBM27Q9P2N5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RBM27Q9P2N5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM27Q9P2N5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM27Q9P2N5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RBM27Q9P2N5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RBM27Q9P2N5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM27Q9P2N5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM27Q9P2N5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM27Q9P2N5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM27Q9P2N5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RBM27Q9P2N5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RBM27Q9P2N5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RBM27Q9P2N5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM27Q9P2N5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM27Q9P2N5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM27Q9P2N5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM27Q9P2N5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM27Q9P2N5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM27Q9P2N5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RBM27Q9P2N5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RBM27Q9P2N5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RBM27Q9P2N5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RBM27Q9P2N5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RBM27Q9P2N5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM27Q9P2N5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM27Q9P2N5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM27Q9P2N5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM27Q9P2N5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM27Q9P2N5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM27Q9P2N5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM27Q9P2N5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RBM27Q9P2N5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RBM27Q9P2N5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RBM27Q9P2N5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RBM27Q9P2N5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RBM27Q9P2N5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RBM27Q9P2N5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RBM27Q9P2N5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
RBM27Q9P2N5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RBM27Q9P2N5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RBM27Q9P2N5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RBM27Q9P2N5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBM27Q9P2N5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBM27Q9P2N5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms