Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDP2Q9P2J9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDP2Q9P2J9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDP2Q9P2J9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDP2Q9P2J9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDP2Q9P2J9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDP2Q9P2J9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDP2Q9P2J9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDP2Q9P2J9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDP2Q9P2J9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PDP2Q9P2J9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDP2Q9P2J9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDP2Q9P2J9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDP2Q9P2J9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDP2Q9P2J9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDP2Q9P2J9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDP2Q9P2J9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PDP2Q9P2J9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDP2Q9P2J9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDP2Q9P2J9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDP2Q9P2J9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDP2Q9P2J9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDP2Q9P2J9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDP2Q9P2J9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDP2Q9P2J9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDP2Q9P2J9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDP2Q9P2J9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDP2Q9P2J9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDP2Q9P2J9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDP2Q9P2J9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDP2Q9P2J9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDP2Q9P2J9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDP2Q9P2J9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDP2Q9P2J9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDP2Q9P2J9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDP2Q9P2J9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDP2Q9P2J9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDP2Q9P2J9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDP2Q9P2J9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDP2Q9P2J9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDP2Q9P2J9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDP2Q9P2J9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDP2Q9P2J9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PDP2Q9P2J9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PDP2Q9P2J9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDP2Q9P2J9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDP2Q9P2J9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDP2Q9P2J9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDP2Q9P2J9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDP2Q9P2J9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDP2Q9P2J9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDP2Q9P2J9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDP2Q9P2J9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDP2Q9P2J9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDP2Q9P2J9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDP2Q9P2J9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDP2Q9P2J9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDP2Q9P2J9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDP2Q9P2J9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDP2Q9P2J9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDP2Q9P2J9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDP2Q9P2J9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDP2Q9P2J9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDP2Q9P2J9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDP2Q9P2J9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDP2Q9P2J9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PDP2Q9P2J9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDP2Q9P2J9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDP2Q9P2J9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDP2Q9P2J9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDP2Q9P2J9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDP2Q9P2J9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDP2Q9P2J9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDP2Q9P2J9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDP2Q9P2J9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDP2Q9P2J9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDP2Q9P2J9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDP2Q9P2J9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDP2Q9P2J9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDP2Q9P2J9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDP2Q9P2J9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDP2Q9P2J9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDP2Q9P2J9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDP2Q9P2J9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDP2Q9P2J9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDP2Q9P2J9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDP2Q9P2J9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDP2Q9P2J9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PDP2Q9P2J9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDP2Q9P2J9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDP2Q9P2J9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms