Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAPAQ9P0L0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAPAQ9P0L0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VAPAQ9P0L0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAPAQ9P0L0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAPAQ9P0L0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAPAQ9P0L0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAPAQ9P0L0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAPAQ9P0L0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAPAQ9P0L0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VAPAQ9P0L0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAPAQ9P0L0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAPAQ9P0L0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAPAQ9P0L0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAPAQ9P0L0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAPAQ9P0L0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAPAQ9P0L0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAPAQ9P0L0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAPAQ9P0L0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VAPAQ9P0L0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VAPAQ9P0L0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAPAQ9P0L0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAPAQ9P0L0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VAPAQ9P0L0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAPAQ9P0L0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VAPAQ9P0L0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAPAQ9P0L0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAPAQ9P0L0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAPAQ9P0L0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAPAQ9P0L0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAPAQ9P0L0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAPAQ9P0L0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAPAQ9P0L0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAPAQ9P0L0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAPAQ9P0L0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAPAQ9P0L0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAPAQ9P0L0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAPAQ9P0L0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAPAQ9P0L0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAPAQ9P0L0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAPAQ9P0L0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAPAQ9P0L0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAPAQ9P0L0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAPAQ9P0L0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAPAQ9P0L0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAPAQ9P0L0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAPAQ9P0L0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAPAQ9P0L0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAPAQ9P0L0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAPAQ9P0L0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAPAQ9P0L0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAPAQ9P0L0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAPAQ9P0L0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAPAQ9P0L0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAPAQ9P0L0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAPAQ9P0L0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAPAQ9P0L0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAPAQ9P0L0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAPAQ9P0L0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAPAQ9P0L0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAPAQ9P0L0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VAPAQ9P0L0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms