Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY72

SCN3B, Sodium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN3BQ9NY72 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN3BQ9NY72 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN3BQ9NY72 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN3BQ9NY72 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN3BQ9NY72 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN3BQ9NY72 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN3BQ9NY72 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN3BQ9NY72 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN3BQ9NY72 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN3BQ9NY72 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN3BQ9NY72 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN3BQ9NY72 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN3BQ9NY72 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN3BQ9NY72 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN3BQ9NY72 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN3BQ9NY72 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms