Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GIN1Q9NXP7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GIN1Q9NXP7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GIN1Q9NXP7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GIN1Q9NXP7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GIN1Q9NXP7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GIN1Q9NXP7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GIN1Q9NXP7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GIN1Q9NXP7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GIN1Q9NXP7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIN1Q9NXP7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIN1Q9NXP7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GIN1Q9NXP7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIN1Q9NXP7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GIN1Q9NXP7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIN1Q9NXP7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GIN1Q9NXP7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GIN1Q9NXP7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GIN1Q9NXP7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GIN1Q9NXP7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GIN1Q9NXP7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIN1Q9NXP7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIN1Q9NXP7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIN1Q9NXP7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIN1Q9NXP7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIN1Q9NXP7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIN1Q9NXP7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIN1Q9NXP7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GIN1Q9NXP7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GIN1Q9NXP7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GIN1Q9NXP7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GIN1Q9NXP7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GIN1Q9NXP7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GIN1Q9NXP7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GIN1Q9NXP7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GIN1Q9NXP7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GIN1Q9NXP7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
GIN1Q9NXP7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GIN1Q9NXP7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GIN1Q9NXP7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GIN1Q9NXP7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GIN1Q9NXP7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GIN1Q9NXP7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GIN1Q9NXP7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GIN1Q9NXP7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GIN1Q9NXP7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms