Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVE7

PANK4, Pantothenate kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANK4Q9NVE7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PANK4Q9NVE7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PANK4Q9NVE7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PANK4Q9NVE7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PANK4Q9NVE7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PANK4Q9NVE7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PANK4Q9NVE7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PANK4Q9NVE7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PANK4Q9NVE7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PANK4Q9NVE7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PANK4Q9NVE7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PANK4Q9NVE7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PANK4Q9NVE7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PANK4Q9NVE7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PANK4Q9NVE7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PANK4Q9NVE7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PANK4Q9NVE7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PANK4Q9NVE7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PANK4Q9NVE7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PANK4Q9NVE7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PANK4Q9NVE7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PANK4Q9NVE7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PANK4Q9NVE7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PANK4Q9NVE7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PANK4Q9NVE7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PANK4Q9NVE7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PANK4Q9NVE7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PANK4Q9NVE7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PANK4Q9NVE7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PANK4Q9NVE7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PANK4Q9NVE7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PANK4Q9NVE7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PANK4Q9NVE7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PANK4Q9NVE7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PANK4Q9NVE7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PANK4Q9NVE7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PANK4Q9NVE7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PANK4Q9NVE7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PANK4Q9NVE7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PANK4Q9NVE7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PANK4Q9NVE7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PANK4Q9NVE7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PANK4Q9NVE7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PANK4Q9NVE7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PANK4Q9NVE7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PANK4Q9NVE7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PANK4Q9NVE7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PANK4Q9NVE7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PANK4Q9NVE7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PANK4Q9NVE7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PANK4Q9NVE7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PANK4Q9NVE7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PANK4Q9NVE7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PANK4Q9NVE7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PANK4Q9NVE7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PANK4Q9NVE7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PANK4Q9NVE7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PANK4Q9NVE7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PANK4Q9NVE7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PANK4Q9NVE7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PANK4Q9NVE7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PANK4Q9NVE7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PANK4Q9NVE7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PANK4Q9NVE7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PANK4Q9NVE7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PANK4Q9NVE7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PANK4Q9NVE7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PANK4Q9NVE7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PANK4Q9NVE7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PANK4Q9NVE7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PANK4Q9NVE7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PANK4Q9NVE7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PANK4Q9NVE7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PANK4Q9NVE7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PANK4Q9NVE7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PANK4Q9NVE7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PANK4Q9NVE7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PANK4Q9NVE7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PANK4Q9NVE7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PANK4Q9NVE7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PANK4Q9NVE7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PANK4Q9NVE7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PANK4Q9NVE7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PANK4Q9NVE7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PANK4Q9NVE7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PANK4Q9NVE7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PANK4Q9NVE7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PANK4Q9NVE7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PANK4Q9NVE7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PANK4Q9NVE7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PANK4Q9NVE7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PANK4Q9NVE7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PANK4Q9NVE7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PANK4Q9NVE7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PANK4Q9NVE7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PANK4Q9NVE7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PANK4Q9NVE7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PANK4Q9NVE7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PANK4Q9NVE7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PANK4Q9NVE7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms