Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV79

PCMTD2, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD2Q9NV79 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCMTD2Q9NV79 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCMTD2Q9NV79 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCMTD2Q9NV79 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCMTD2Q9NV79 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PCMTD2Q9NV79 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCMTD2Q9NV79 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCMTD2Q9NV79 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCMTD2Q9NV79 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCMTD2Q9NV79 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCMTD2Q9NV79 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCMTD2Q9NV79 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCMTD2Q9NV79 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCMTD2Q9NV79 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCMTD2Q9NV79 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCMTD2Q9NV79 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCMTD2Q9NV79 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCMTD2Q9NV79 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCMTD2Q9NV79 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCMTD2Q9NV79 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCMTD2Q9NV79 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCMTD2Q9NV79 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCMTD2Q9NV79 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCMTD2Q9NV79 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCMTD2Q9NV79 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCMTD2Q9NV79 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCMTD2Q9NV79 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCMTD2Q9NV79 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCMTD2Q9NV79 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCMTD2Q9NV79 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCMTD2Q9NV79 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCMTD2Q9NV79 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCMTD2Q9NV79 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCMTD2Q9NV79 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCMTD2Q9NV79 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCMTD2Q9NV79 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCMTD2Q9NV79 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCMTD2Q9NV79 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCMTD2Q9NV79 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms