Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPMQ9NSP4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms