Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF275Q9NSD4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF275Q9NSD4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF275Q9NSD4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF275Q9NSD4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF275Q9NSD4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF275Q9NSD4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF275Q9NSD4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF275Q9NSD4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF275Q9NSD4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF275Q9NSD4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF275Q9NSD4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF275Q9NSD4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF275Q9NSD4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF275Q9NSD4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF275Q9NSD4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF275Q9NSD4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF275Q9NSD4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF275Q9NSD4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF275Q9NSD4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF275Q9NSD4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF275Q9NSD4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF275Q9NSD4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF275Q9NSD4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF275Q9NSD4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF275Q9NSD4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF275Q9NSD4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF275Q9NSD4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF275Q9NSD4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF275Q9NSD4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF275Q9NSD4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF275Q9NSD4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF275Q9NSD4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF275Q9NSD4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF275Q9NSD4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF275Q9NSD4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF275Q9NSD4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF275Q9NSD4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF275Q9NSD4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF275Q9NSD4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF275Q9NSD4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF275Q9NSD4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF275Q9NSD4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF275Q9NSD4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF275Q9NSD4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF275Q9NSD4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF275Q9NSD4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF275Q9NSD4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF275Q9NSD4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF275Q9NSD4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms