Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY6

PLSCR3, Phospholipid scramblase 3, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLSCR3Q9NRY6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLSCR3Q9NRY6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLSCR3Q9NRY6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLSCR3Q9NRY6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLSCR3Q9NRY6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLSCR3Q9NRY6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLSCR3Q9NRY6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PLSCR3Q9NRY6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLSCR3Q9NRY6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLSCR3Q9NRY6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLSCR3Q9NRY6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLSCR3Q9NRY6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLSCR3Q9NRY6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLSCR3Q9NRY6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLSCR3Q9NRY6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLSCR3Q9NRY6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLSCR3Q9NRY6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLSCR3Q9NRY6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PLSCR3Q9NRY6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms