Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPF2

CHST11, Carbohydrate sulfotransferase 11, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST11Q9NPF2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHST11Q9NPF2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHST11Q9NPF2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHST11Q9NPF2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHST11Q9NPF2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHST11Q9NPF2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHST11Q9NPF2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHST11Q9NPF2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHST11Q9NPF2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHST11Q9NPF2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHST11Q9NPF2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHST11Q9NPF2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHST11Q9NPF2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHST11Q9NPF2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHST11Q9NPF2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST11Q9NPF2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST11Q9NPF2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST11Q9NPF2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST11Q9NPF2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST11Q9NPF2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST11Q9NPF2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST11Q9NPF2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST11Q9NPF2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST11Q9NPF2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST11Q9NPF2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST11Q9NPF2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST11Q9NPF2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST11Q9NPF2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST11Q9NPF2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST11Q9NPF2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST11Q9NPF2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST11Q9NPF2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST11Q9NPF2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST11Q9NPF2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST11Q9NPF2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST11Q9NPF2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST11Q9NPF2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST11Q9NPF2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST11Q9NPF2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST11Q9NPF2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST11Q9NPF2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHST11Q9NPF2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms