Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ3

DNAJC4, DnaJ homolog subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC4Q9NNZ3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DNAJC4Q9NNZ3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DNAJC4Q9NNZ3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DNAJC4Q9NNZ3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DNAJC4Q9NNZ3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DNAJC4Q9NNZ3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DNAJC4Q9NNZ3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC4Q9NNZ3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC4Q9NNZ3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC4Q9NNZ3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC4Q9NNZ3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC4Q9NNZ3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC4Q9NNZ3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DNAJC4Q9NNZ3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DNAJC4Q9NNZ3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
DNAJC4Q9NNZ3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DNAJC4Q9NNZ3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DNAJC4Q9NNZ3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DNAJC4Q9NNZ3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DNAJC4Q9NNZ3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms