Protein–RNA interactions for Protein: Q9N2J8

HERV-H_2q24.1 provirus ancestral Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9N2J8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9N2J8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9N2J8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9N2J8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9N2J8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9N2J8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9N2J8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9N2J8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9N2J8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9N2J8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9N2J8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9N2J8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9N2J8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9N2J8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9N2J8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9N2J8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9N2J8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9N2J8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9N2J8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9N2J8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9N2J8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9N2J8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9N2J8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9N2J8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9N2J8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9N2J8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9N2J8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9N2J8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9N2J8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9N2J8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9N2J8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9N2J8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9N2J8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9N2J8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9N2J8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9N2J8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9N2J8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9N2J8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9N2J8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9N2J8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9N2J8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9N2J8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9N2J8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9N2J8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9N2J8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9N2J8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9N2J8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9N2J8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9N2J8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9N2J8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9N2J8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9N2J8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9N2J8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9N2J8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9N2J8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9N2J8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9N2J8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9N2J8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9N2J8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9N2J8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9N2J8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9N2J8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9N2J8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9N2J8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9N2J8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9N2J8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9N2J8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9N2J8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9N2J8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9N2J8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9N2J8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9N2J8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9N2J8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9N2J8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9N2J8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9N2J8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9N2J8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9N2J8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9N2J8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9N2J8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9N2J8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9N2J8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9N2J8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9N2J8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9N2J8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9N2J8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9N2J8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9N2J8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9N2J8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9N2J8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9N2J8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9N2J8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9N2J8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9N2J8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9N2J8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9N2J8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9N2J8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9N2J8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9N2J8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9N2J8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms