Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ERVK-5Q9HDB9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERVK-5Q9HDB9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ERVK-5Q9HDB9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERVK-5Q9HDB9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERVK-5Q9HDB9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERVK-5Q9HDB9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERVK-5Q9HDB9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERVK-5Q9HDB9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVK-5Q9HDB9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVK-5Q9HDB9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERVK-5Q9HDB9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERVK-5Q9HDB9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERVK-5Q9HDB9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVK-5Q9HDB9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVK-5Q9HDB9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVK-5Q9HDB9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVK-5Q9HDB9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVK-5Q9HDB9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVK-5Q9HDB9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVK-5Q9HDB9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVK-5Q9HDB9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERVK-5Q9HDB9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERVK-5Q9HDB9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERVK-5Q9HDB9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ERVK-5Q9HDB9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERVK-5Q9HDB9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERVK-5Q9HDB9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVK-5Q9HDB9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVK-5Q9HDB9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVK-5Q9HDB9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVK-5Q9HDB9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERVK-5Q9HDB9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERVK-5Q9HDB9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERVK-5Q9HDB9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERVK-5Q9HDB9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERVK-5Q9HDB9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERVK-5Q9HDB9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERVK-5Q9HDB9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ERVK-5Q9HDB9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERVK-5Q9HDB9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERVK-5Q9HDB9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVK-5Q9HDB9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVK-5Q9HDB9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVK-5Q9HDB9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVK-5Q9HDB9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVK-5Q9HDB9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVK-5Q9HDB9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
ERVK-5Q9HDB9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERVK-5Q9HDB9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERVK-5Q9HDB9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERVK-5Q9HDB9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERVK-5Q9HDB9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERVK-5Q9HDB9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERVK-5Q9HDB9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVK-5Q9HDB9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVK-5Q9HDB9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVK-5Q9HDB9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVK-5Q9HDB9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVK-5Q9HDB9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVK-5Q9HDB9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVK-5Q9HDB9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVK-5Q9HDB9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVK-5Q9HDB9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVK-5Q9HDB9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVK-5Q9HDB9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVK-5Q9HDB9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVK-5Q9HDB9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVK-5Q9HDB9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVK-5Q9HDB9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVK-5Q9HDB9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERVK-5Q9HDB9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERVK-5Q9HDB9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ERVK-5Q9HDB9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERVK-5Q9HDB9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERVK-5Q9HDB9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERVK-5Q9HDB9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERVK-5Q9HDB9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERVK-5Q9HDB9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERVK-5Q9HDB9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
ERVK-5Q9HDB9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERVK-5Q9HDB9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVK-5Q9HDB9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVK-5Q9HDB9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVK-5Q9HDB9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVK-5Q9HDB9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVK-5Q9HDB9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVK-5Q9HDB9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVK-5Q9HDB9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVK-5Q9HDB9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVK-5Q9HDB9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVK-5Q9HDB9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVK-5Q9HDB9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVK-5Q9HDB9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVK-5Q9HDB9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVK-5Q9HDB9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVK-5Q9HDB9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ERVK-5Q9HDB9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERVK-5Q9HDB9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERVK-5Q9HDB9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms