Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRMS1Q9HCU9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRMS1Q9HCU9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRMS1Q9HCU9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRMS1Q9HCU9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRMS1Q9HCU9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRMS1Q9HCU9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRMS1Q9HCU9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRMS1Q9HCU9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRMS1Q9HCU9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRMS1Q9HCU9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRMS1Q9HCU9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRMS1Q9HCU9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRMS1Q9HCU9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRMS1Q9HCU9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRMS1Q9HCU9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRMS1Q9HCU9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRMS1Q9HCU9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRMS1Q9HCU9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRMS1Q9HCU9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRMS1Q9HCU9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRMS1Q9HCU9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRMS1Q9HCU9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRMS1Q9HCU9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRMS1Q9HCU9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRMS1Q9HCU9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRMS1Q9HCU9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRMS1Q9HCU9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRMS1Q9HCU9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRMS1Q9HCU9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRMS1Q9HCU9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRMS1Q9HCU9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRMS1Q9HCU9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BRMS1Q9HCU9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
BRMS1Q9HCU9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRMS1Q9HCU9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
BRMS1Q9HCU9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
BRMS1Q9HCU9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRMS1Q9HCU9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRMS1Q9HCU9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRMS1Q9HCU9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRMS1Q9HCU9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRMS1Q9HCU9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRMS1Q9HCU9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRMS1Q9HCU9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRMS1Q9HCU9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRMS1Q9HCU9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRMS1Q9HCU9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRMS1Q9HCU9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRMS1Q9HCU9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRMS1Q9HCU9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRMS1Q9HCU9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRMS1Q9HCU9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRMS1Q9HCU9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRMS1Q9HCU9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
BRMS1Q9HCU9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRMS1Q9HCU9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRMS1Q9HCU9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRMS1Q9HCU9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRMS1Q9HCU9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRMS1Q9HCU9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRMS1Q9HCU9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRMS1Q9HCU9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRMS1Q9HCU9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms