Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMURF1Q9HCE7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMURF1Q9HCE7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMURF1Q9HCE7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMURF1Q9HCE7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMURF1Q9HCE7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMURF1Q9HCE7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMURF1Q9HCE7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMURF1Q9HCE7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMURF1Q9HCE7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMURF1Q9HCE7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMURF1Q9HCE7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMURF1Q9HCE7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMURF1Q9HCE7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMURF1Q9HCE7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMURF1Q9HCE7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMURF1Q9HCE7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMURF1Q9HCE7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMURF1Q9HCE7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMURF1Q9HCE7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMURF1Q9HCE7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMURF1Q9HCE7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMURF1Q9HCE7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMURF1Q9HCE7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMURF1Q9HCE7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMURF1Q9HCE7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SMURF1Q9HCE7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMURF1Q9HCE7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMURF1Q9HCE7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMURF1Q9HCE7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMURF1Q9HCE7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 220 ms