Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM27Q9HBJ8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM27Q9HBJ8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM27Q9HBJ8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM27Q9HBJ8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM27Q9HBJ8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM27Q9HBJ8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM27Q9HBJ8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM27Q9HBJ8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM27Q9HBJ8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMEM27Q9HBJ8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMEM27Q9HBJ8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM27Q9HBJ8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM27Q9HBJ8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM27Q9HBJ8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms