Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAD4

WDR41, WD repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR41Q9HAD4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
WDR41Q9HAD4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
WDR41Q9HAD4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
WDR41Q9HAD4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
WDR41Q9HAD4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
WDR41Q9HAD4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
WDR41Q9HAD4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
WDR41Q9HAD4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
WDR41Q9HAD4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
WDR41Q9HAD4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
WDR41Q9HAD4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
WDR41Q9HAD4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
WDR41Q9HAD4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
WDR41Q9HAD4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
WDR41Q9HAD4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
WDR41Q9HAD4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
WDR41Q9HAD4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
WDR41Q9HAD4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
WDR41Q9HAD4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
WDR41Q9HAD4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
WDR41Q9HAD4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
WDR41Q9HAD4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
WDR41Q9HAD4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
WDR41Q9HAD4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR41Q9HAD4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR41Q9HAD4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR41Q9HAD4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR41Q9HAD4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR41Q9HAD4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR41Q9HAD4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR41Q9HAD4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR41Q9HAD4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR41Q9HAD4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR41Q9HAD4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR41Q9HAD4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR41Q9HAD4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR41Q9HAD4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR41Q9HAD4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR41Q9HAD4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR41Q9HAD4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR41Q9HAD4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR41Q9HAD4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR41Q9HAD4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR41Q9HAD4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR41Q9HAD4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR41Q9HAD4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR41Q9HAD4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR41Q9HAD4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR41Q9HAD4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR41Q9HAD4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR41Q9HAD4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR41Q9HAD4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR41Q9HAD4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR41Q9HAD4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR41Q9HAD4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR41Q9HAD4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR41Q9HAD4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms