Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB8

PPCS, Phosphopantothenate--cysteine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCSQ9HAB8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPCSQ9HAB8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPCSQ9HAB8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPCSQ9HAB8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPCSQ9HAB8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PPCSQ9HAB8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPCSQ9HAB8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPCSQ9HAB8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPCSQ9HAB8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPCSQ9HAB8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPCSQ9HAB8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPCSQ9HAB8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPCSQ9HAB8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPCSQ9HAB8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPCSQ9HAB8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPCSQ9HAB8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPCSQ9HAB8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPCSQ9HAB8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPCSQ9HAB8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPCSQ9HAB8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPCSQ9HAB8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPCSQ9HAB8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPCSQ9HAB8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPCSQ9HAB8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPCSQ9HAB8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPCSQ9HAB8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPCSQ9HAB8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPCSQ9HAB8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPCSQ9HAB8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPCSQ9HAB8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPCSQ9HAB8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPCSQ9HAB8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPCSQ9HAB8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPCSQ9HAB8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPCSQ9HAB8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPCSQ9HAB8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPCSQ9HAB8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPCSQ9HAB8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPCSQ9HAB8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPCSQ9HAB8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPCSQ9HAB8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPCSQ9HAB8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPCSQ9HAB8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPCSQ9HAB8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPCSQ9HAB8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPCSQ9HAB8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPCSQ9HAB8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPCSQ9HAB8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPCSQ9HAB8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPCSQ9HAB8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPCSQ9HAB8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPCSQ9HAB8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPCSQ9HAB8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPCSQ9HAB8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPCSQ9HAB8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPCSQ9HAB8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPCSQ9HAB8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPCSQ9HAB8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPCSQ9HAB8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPCSQ9HAB8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPCSQ9HAB8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPCSQ9HAB8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPCSQ9HAB8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPCSQ9HAB8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPCSQ9HAB8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPCSQ9HAB8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPCSQ9HAB8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PPCSQ9HAB8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPCSQ9HAB8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPCSQ9HAB8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPCSQ9HAB8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPCSQ9HAB8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPCSQ9HAB8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PPCSQ9HAB8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPCSQ9HAB8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPCSQ9HAB8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPCSQ9HAB8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPCSQ9HAB8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPCSQ9HAB8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPCSQ9HAB8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPCSQ9HAB8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPCSQ9HAB8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPCSQ9HAB8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPCSQ9HAB8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPCSQ9HAB8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPCSQ9HAB8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPCSQ9HAB8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPCSQ9HAB8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPCSQ9HAB8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPCSQ9HAB8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPCSQ9HAB8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPCSQ9HAB8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPCSQ9HAB8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PPCSQ9HAB8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPCSQ9HAB8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPCSQ9HAB8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPCSQ9HAB8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPCSQ9HAB8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPCSQ9HAB8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPCSQ9HAB8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms