Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S0

NANOG, Homeobox protein NANOG, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGQ9H9S0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NANOGQ9H9S0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NANOGQ9H9S0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NANOGQ9H9S0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NANOGQ9H9S0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NANOGQ9H9S0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NANOGQ9H9S0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NANOGQ9H9S0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NANOGQ9H9S0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NANOGQ9H9S0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NANOGQ9H9S0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NANOGQ9H9S0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NANOGQ9H9S0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NANOGQ9H9S0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NANOGQ9H9S0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NANOGQ9H9S0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NANOGQ9H9S0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NANOGQ9H9S0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NANOGQ9H9S0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NANOGQ9H9S0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NANOGQ9H9S0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NANOGQ9H9S0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NANOGQ9H9S0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NANOGQ9H9S0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NANOGQ9H9S0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NANOGQ9H9S0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NANOGQ9H9S0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NANOGQ9H9S0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NANOGQ9H9S0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NANOGQ9H9S0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NANOGQ9H9S0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NANOGQ9H9S0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NANOGQ9H9S0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NANOGQ9H9S0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NANOGQ9H9S0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NANOGQ9H9S0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NANOGQ9H9S0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NANOGQ9H9S0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NANOGQ9H9S0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NANOGQ9H9S0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NANOGQ9H9S0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NANOGQ9H9S0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NANOGQ9H9S0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NANOGQ9H9S0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NANOGQ9H9S0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NANOGQ9H9S0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NANOGQ9H9S0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NANOGQ9H9S0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NANOGQ9H9S0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NANOGQ9H9S0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NANOGQ9H9S0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NANOGQ9H9S0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NANOGQ9H9S0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NANOGQ9H9S0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NANOGQ9H9S0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NANOGQ9H9S0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NANOGQ9H9S0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NANOGQ9H9S0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NANOGQ9H9S0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NANOGQ9H9S0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NANOGQ9H9S0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NANOGQ9H9S0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NANOGQ9H9S0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NANOGQ9H9S0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NANOGQ9H9S0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NANOGQ9H9S0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NANOGQ9H9S0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NANOGQ9H9S0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NANOGQ9H9S0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NANOGQ9H9S0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NANOGQ9H9S0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms