Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q4

NHEJ1, Non-homologous end-joining factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHEJ1Q9H9Q4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NHEJ1Q9H9Q4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NHEJ1Q9H9Q4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NHEJ1Q9H9Q4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NHEJ1Q9H9Q4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NHEJ1Q9H9Q4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NHEJ1Q9H9Q4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NHEJ1Q9H9Q4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NHEJ1Q9H9Q4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NHEJ1Q9H9Q4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NHEJ1Q9H9Q4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NHEJ1Q9H9Q4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NHEJ1Q9H9Q4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NHEJ1Q9H9Q4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NHEJ1Q9H9Q4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NHEJ1Q9H9Q4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NHEJ1Q9H9Q4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NHEJ1Q9H9Q4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NHEJ1Q9H9Q4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NHEJ1Q9H9Q4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NHEJ1Q9H9Q4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NHEJ1Q9H9Q4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NHEJ1Q9H9Q4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NHEJ1Q9H9Q4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NHEJ1Q9H9Q4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NHEJ1Q9H9Q4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NHEJ1Q9H9Q4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NHEJ1Q9H9Q4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NHEJ1Q9H9Q4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NHEJ1Q9H9Q4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NHEJ1Q9H9Q4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NHEJ1Q9H9Q4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NHEJ1Q9H9Q4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NHEJ1Q9H9Q4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NHEJ1Q9H9Q4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NHEJ1Q9H9Q4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NHEJ1Q9H9Q4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NHEJ1Q9H9Q4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NHEJ1Q9H9Q4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NHEJ1Q9H9Q4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NHEJ1Q9H9Q4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NHEJ1Q9H9Q4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NHEJ1Q9H9Q4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NHEJ1Q9H9Q4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NHEJ1Q9H9Q4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NHEJ1Q9H9Q4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NHEJ1Q9H9Q4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NHEJ1Q9H9Q4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NHEJ1Q9H9Q4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NHEJ1Q9H9Q4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NHEJ1Q9H9Q4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NHEJ1Q9H9Q4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NHEJ1Q9H9Q4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NHEJ1Q9H9Q4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NHEJ1Q9H9Q4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NHEJ1Q9H9Q4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NHEJ1Q9H9Q4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NHEJ1Q9H9Q4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NHEJ1Q9H9Q4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NHEJ1Q9H9Q4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NHEJ1Q9H9Q4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NHEJ1Q9H9Q4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NHEJ1Q9H9Q4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHEJ1Q9H9Q4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHEJ1Q9H9Q4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHEJ1Q9H9Q4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHEJ1Q9H9Q4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHEJ1Q9H9Q4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHEJ1Q9H9Q4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHEJ1Q9H9Q4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHEJ1Q9H9Q4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHEJ1Q9H9Q4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NHEJ1Q9H9Q4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NHEJ1Q9H9Q4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NHEJ1Q9H9Q4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHEJ1Q9H9Q4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHEJ1Q9H9Q4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHEJ1Q9H9Q4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHEJ1Q9H9Q4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHEJ1Q9H9Q4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHEJ1Q9H9Q4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHEJ1Q9H9Q4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHEJ1Q9H9Q4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NHEJ1Q9H9Q4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NHEJ1Q9H9Q4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NHEJ1Q9H9Q4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NHEJ1Q9H9Q4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NHEJ1Q9H9Q4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NHEJ1Q9H9Q4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NHEJ1Q9H9Q4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NHEJ1Q9H9Q4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NHEJ1Q9H9Q4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NHEJ1Q9H9Q4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NHEJ1Q9H9Q4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NHEJ1Q9H9Q4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NHEJ1Q9H9Q4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NHEJ1Q9H9Q4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NHEJ1Q9H9Q4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms