Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRDE2Q9H7Z3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRDE2Q9H7Z3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRDE2Q9H7Z3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRDE2Q9H7Z3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NRDE2Q9H7Z3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NRDE2Q9H7Z3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NRDE2Q9H7Z3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRDE2Q9H7Z3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRDE2Q9H7Z3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NRDE2Q9H7Z3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRDE2Q9H7Z3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRDE2Q9H7Z3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRDE2Q9H7Z3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRDE2Q9H7Z3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRDE2Q9H7Z3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRDE2Q9H7Z3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRDE2Q9H7Z3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRDE2Q9H7Z3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRDE2Q9H7Z3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRDE2Q9H7Z3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRDE2Q9H7Z3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRDE2Q9H7Z3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRDE2Q9H7Z3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NRDE2Q9H7Z3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRDE2Q9H7Z3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRDE2Q9H7Z3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRDE2Q9H7Z3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRDE2Q9H7Z3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRDE2Q9H7Z3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRDE2Q9H7Z3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NRDE2Q9H7Z3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NRDE2Q9H7Z3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NRDE2Q9H7Z3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NRDE2Q9H7Z3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NRDE2Q9H7Z3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NRDE2Q9H7Z3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NRDE2Q9H7Z3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRDE2Q9H7Z3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRDE2Q9H7Z3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRDE2Q9H7Z3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRDE2Q9H7Z3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRDE2Q9H7Z3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NRDE2Q9H7Z3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NRDE2Q9H7Z3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NRDE2Q9H7Z3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NRDE2Q9H7Z3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NRDE2Q9H7Z3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NRDE2Q9H7Z3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NRDE2Q9H7Z3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NRDE2Q9H7Z3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NRDE2Q9H7Z3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NRDE2Q9H7Z3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NRDE2Q9H7Z3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NRDE2Q9H7Z3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NRDE2Q9H7Z3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NRDE2Q9H7Z3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NRDE2Q9H7Z3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NRDE2Q9H7Z3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRDE2Q9H7Z3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRDE2Q9H7Z3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRDE2Q9H7Z3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRDE2Q9H7Z3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRDE2Q9H7Z3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRDE2Q9H7Z3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRDE2Q9H7Z3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRDE2Q9H7Z3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRDE2Q9H7Z3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRDE2Q9H7Z3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRDE2Q9H7Z3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRDE2Q9H7Z3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRDE2Q9H7Z3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRDE2Q9H7Z3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRDE2Q9H7Z3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRDE2Q9H7Z3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NRDE2Q9H7Z3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NRDE2Q9H7Z3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRDE2Q9H7Z3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRDE2Q9H7Z3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRDE2Q9H7Z3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRDE2Q9H7Z3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRDE2Q9H7Z3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRDE2Q9H7Z3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRDE2Q9H7Z3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRDE2Q9H7Z3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRDE2Q9H7Z3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRDE2Q9H7Z3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRDE2Q9H7Z3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRDE2Q9H7Z3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRDE2Q9H7Z3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NRDE2Q9H7Z3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRDE2Q9H7Z3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRDE2Q9H7Z3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms