Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4M9

EHD1, EH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1Q9H4M9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EHD1Q9H4M9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EHD1Q9H4M9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EHD1Q9H4M9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EHD1Q9H4M9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EHD1Q9H4M9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EHD1Q9H4M9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EHD1Q9H4M9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EHD1Q9H4M9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EHD1Q9H4M9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EHD1Q9H4M9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EHD1Q9H4M9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EHD1Q9H4M9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EHD1Q9H4M9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EHD1Q9H4M9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EHD1Q9H4M9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EHD1Q9H4M9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EHD1Q9H4M9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EHD1Q9H4M9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EHD1Q9H4M9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EHD1Q9H4M9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EHD1Q9H4M9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EHD1Q9H4M9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EHD1Q9H4M9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EHD1Q9H4M9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EHD1Q9H4M9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EHD1Q9H4M9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EHD1Q9H4M9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EHD1Q9H4M9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EHD1Q9H4M9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EHD1Q9H4M9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EHD1Q9H4M9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EHD1Q9H4M9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EHD1Q9H4M9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EHD1Q9H4M9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EHD1Q9H4M9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EHD1Q9H4M9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EHD1Q9H4M9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EHD1Q9H4M9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EHD1Q9H4M9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EHD1Q9H4M9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EHD1Q9H4M9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EHD1Q9H4M9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EHD1Q9H4M9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EHD1Q9H4M9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EHD1Q9H4M9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EHD1Q9H4M9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EHD1Q9H4M9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EHD1Q9H4M9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EHD1Q9H4M9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EHD1Q9H4M9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EHD1Q9H4M9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EHD1Q9H4M9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EHD1Q9H4M9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EHD1Q9H4M9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EHD1Q9H4M9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EHD1Q9H4M9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EHD1Q9H4M9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EHD1Q9H4M9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EHD1Q9H4M9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EHD1Q9H4M9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EHD1Q9H4M9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EHD1Q9H4M9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EHD1Q9H4M9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD1Q9H4M9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD1Q9H4M9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD1Q9H4M9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD1Q9H4M9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD1Q9H4M9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD1Q9H4M9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD1Q9H4M9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD1Q9H4M9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD1Q9H4M9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD1Q9H4M9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD1Q9H4M9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EHD1Q9H4M9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EHD1Q9H4M9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD1Q9H4M9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD1Q9H4M9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD1Q9H4M9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD1Q9H4M9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD1Q9H4M9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD1Q9H4M9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD1Q9H4M9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD1Q9H4M9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD1Q9H4M9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD1Q9H4M9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD1Q9H4M9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD1Q9H4M9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD1Q9H4M9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD1Q9H4M9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD1Q9H4M9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD1Q9H4M9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD1Q9H4M9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD1Q9H4M9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD1Q9H4M9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD1Q9H4M9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD1Q9H4M9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EHD1Q9H4M9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EHD1Q9H4M9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms