Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3U5

MFSD1, Major facilitator superfamily domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1Q9H3U5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MFSD1Q9H3U5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MFSD1Q9H3U5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MFSD1Q9H3U5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MFSD1Q9H3U5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MFSD1Q9H3U5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MFSD1Q9H3U5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MFSD1Q9H3U5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MFSD1Q9H3U5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MFSD1Q9H3U5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MFSD1Q9H3U5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MFSD1Q9H3U5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MFSD1Q9H3U5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MFSD1Q9H3U5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MFSD1Q9H3U5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MFSD1Q9H3U5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MFSD1Q9H3U5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MFSD1Q9H3U5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MFSD1Q9H3U5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MFSD1Q9H3U5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MFSD1Q9H3U5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MFSD1Q9H3U5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MFSD1Q9H3U5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MFSD1Q9H3U5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MFSD1Q9H3U5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MFSD1Q9H3U5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MFSD1Q9H3U5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MFSD1Q9H3U5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms