Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TNMDQ9H2S6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TNMDQ9H2S6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNMDQ9H2S6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNMDQ9H2S6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNMDQ9H2S6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TNMDQ9H2S6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNMDQ9H2S6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNMDQ9H2S6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNMDQ9H2S6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNMDQ9H2S6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNMDQ9H2S6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNMDQ9H2S6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNMDQ9H2S6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNMDQ9H2S6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNMDQ9H2S6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TNMDQ9H2S6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNMDQ9H2S6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNMDQ9H2S6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNMDQ9H2S6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNMDQ9H2S6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNMDQ9H2S6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNMDQ9H2S6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNMDQ9H2S6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TNMDQ9H2S6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TNMDQ9H2S6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TNMDQ9H2S6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNMDQ9H2S6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNMDQ9H2S6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNMDQ9H2S6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNMDQ9H2S6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNMDQ9H2S6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNMDQ9H2S6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNMDQ9H2S6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNMDQ9H2S6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNMDQ9H2S6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNMDQ9H2S6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNMDQ9H2S6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNMDQ9H2S6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNMDQ9H2S6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNMDQ9H2S6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNMDQ9H2S6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNMDQ9H2S6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNMDQ9H2S6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNMDQ9H2S6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNMDQ9H2S6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TNMDQ9H2S6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNMDQ9H2S6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNMDQ9H2S6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNMDQ9H2S6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNMDQ9H2S6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNMDQ9H2S6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNMDQ9H2S6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNMDQ9H2S6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNMDQ9H2S6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms