Protein–RNA interactions for Protein: Q9H089

LSG1, Large subunit GTPase 1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSG1Q9H089 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LSG1Q9H089 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LSG1Q9H089 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LSG1Q9H089 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LSG1Q9H089 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LSG1Q9H089 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LSG1Q9H089 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LSG1Q9H089 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LSG1Q9H089 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LSG1Q9H089 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LSG1Q9H089 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LSG1Q9H089 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LSG1Q9H089 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LSG1Q9H089 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LSG1Q9H089 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LSG1Q9H089 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LSG1Q9H089 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LSG1Q9H089 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LSG1Q9H089 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LSG1Q9H089 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
LSG1Q9H089 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LSG1Q9H089 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LSG1Q9H089 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LSG1Q9H089 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
LSG1Q9H089 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LSG1Q9H089 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LSG1Q9H089 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LSG1Q9H089 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LSG1Q9H089 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LSG1Q9H089 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LSG1Q9H089 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LSG1Q9H089 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LSG1Q9H089 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LSG1Q9H089 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LSG1Q9H089 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LSG1Q9H089 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LSG1Q9H089 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
LSG1Q9H089 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LSG1Q9H089 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LSG1Q9H089 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LSG1Q9H089 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
LSG1Q9H089 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LSG1Q9H089 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LSG1Q9H089 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LSG1Q9H089 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LSG1Q9H089 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LSG1Q9H089 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LSG1Q9H089 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LSG1Q9H089 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LSG1Q9H089 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LSG1Q9H089 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LSG1Q9H089 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LSG1Q9H089 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LSG1Q9H089 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LSG1Q9H089 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LSG1Q9H089 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LSG1Q9H089 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LSG1Q9H089 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LSG1Q9H089 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LSG1Q9H089 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
LSG1Q9H089 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LSG1Q9H089 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LSG1Q9H089 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LSG1Q9H089 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms