Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSP1Q9GZU7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSP1Q9GZU7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CTDSP1Q9GZU7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms