Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B6

BRINP2, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP2Q9C0B6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BRINP2Q9C0B6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRINP2Q9C0B6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRINP2Q9C0B6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRINP2Q9C0B6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRINP2Q9C0B6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRINP2Q9C0B6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRINP2Q9C0B6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRINP2Q9C0B6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRINP2Q9C0B6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRINP2Q9C0B6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRINP2Q9C0B6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRINP2Q9C0B6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRINP2Q9C0B6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRINP2Q9C0B6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRINP2Q9C0B6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BRINP2Q9C0B6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BRINP2Q9C0B6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRINP2Q9C0B6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRINP2Q9C0B6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRINP2Q9C0B6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRINP2Q9C0B6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRINP2Q9C0B6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRINP2Q9C0B6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRINP2Q9C0B6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRINP2Q9C0B6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRINP2Q9C0B6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRINP2Q9C0B6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRINP2Q9C0B6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRINP2Q9C0B6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRINP2Q9C0B6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRINP2Q9C0B6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BRINP2Q9C0B6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRINP2Q9C0B6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRINP2Q9C0B6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRINP2Q9C0B6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms