Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM54Q9BYV2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM54Q9BYV2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM54Q9BYV2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM54Q9BYV2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM54Q9BYV2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM54Q9BYV2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM54Q9BYV2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM54Q9BYV2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM54Q9BYV2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM54Q9BYV2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM54Q9BYV2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM54Q9BYV2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM54Q9BYV2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM54Q9BYV2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM54Q9BYV2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM54Q9BYV2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM54Q9BYV2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM54Q9BYV2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM54Q9BYV2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM54Q9BYV2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM54Q9BYV2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM54Q9BYV2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM54Q9BYV2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM54Q9BYV2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM54Q9BYV2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM54Q9BYV2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM54Q9BYV2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM54Q9BYV2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM54Q9BYV2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM54Q9BYV2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM54Q9BYV2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM54Q9BYV2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM54Q9BYV2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM54Q9BYV2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM54Q9BYV2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM54Q9BYV2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM54Q9BYV2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM54Q9BYV2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM54Q9BYV2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM54Q9BYV2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM54Q9BYV2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM54Q9BYV2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM54Q9BYV2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM54Q9BYV2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM54Q9BYV2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM54Q9BYV2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM54Q9BYV2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM54Q9BYV2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM54Q9BYV2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM54Q9BYV2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM54Q9BYV2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM54Q9BYV2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM54Q9BYV2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM54Q9BYV2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM54Q9BYV2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM54Q9BYV2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM54Q9BYV2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM54Q9BYV2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM54Q9BYV2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM54Q9BYV2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM54Q9BYV2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM54Q9BYV2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM54Q9BYV2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM54Q9BYV2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM54Q9BYV2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM54Q9BYV2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM54Q9BYV2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM54Q9BYV2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM54Q9BYV2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM54Q9BYV2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM54Q9BYV2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM54Q9BYV2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM54Q9BYV2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM54Q9BYV2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM54Q9BYV2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM54Q9BYV2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM54Q9BYV2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM54Q9BYV2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM54Q9BYV2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM54Q9BYV2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM54Q9BYV2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM54Q9BYV2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM54Q9BYV2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM54Q9BYV2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM54Q9BYV2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM54Q9BYV2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM54Q9BYV2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM54Q9BYV2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM54Q9BYV2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM54Q9BYV2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM54Q9BYV2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM54Q9BYV2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM54Q9BYV2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM54Q9BYV2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM54Q9BYV2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM54Q9BYV2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM54Q9BYV2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM54Q9BYV2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM54Q9BYV2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms