Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD6

MRPL1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL1Q9BYD6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL1Q9BYD6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL1Q9BYD6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL1Q9BYD6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL1Q9BYD6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL1Q9BYD6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL1Q9BYD6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL1Q9BYD6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL1Q9BYD6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL1Q9BYD6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL1Q9BYD6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL1Q9BYD6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL1Q9BYD6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL1Q9BYD6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL1Q9BYD6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL1Q9BYD6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL1Q9BYD6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL1Q9BYD6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL1Q9BYD6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL1Q9BYD6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL1Q9BYD6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL1Q9BYD6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL1Q9BYD6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MRPL1Q9BYD6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRPL1Q9BYD6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MRPL1Q9BYD6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPL1Q9BYD6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPL1Q9BYD6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPL1Q9BYD6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPL1Q9BYD6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPL1Q9BYD6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPL1Q9BYD6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPL1Q9BYD6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPL1Q9BYD6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPL1Q9BYD6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPL1Q9BYD6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPL1Q9BYD6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL1Q9BYD6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL1Q9BYD6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL1Q9BYD6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL1Q9BYD6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL1Q9BYD6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL1Q9BYD6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL1Q9BYD6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPL1Q9BYD6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPL1Q9BYD6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPL1Q9BYD6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPL1Q9BYD6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL1Q9BYD6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL1Q9BYD6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL1Q9BYD6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL1Q9BYD6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL1Q9BYD6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL1Q9BYD6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL1Q9BYD6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPL1Q9BYD6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms