Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB1

LGR4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR4Q9BXB1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LGR4Q9BXB1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LGR4Q9BXB1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LGR4Q9BXB1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LGR4Q9BXB1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LGR4Q9BXB1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LGR4Q9BXB1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LGR4Q9BXB1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LGR4Q9BXB1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LGR4Q9BXB1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LGR4Q9BXB1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LGR4Q9BXB1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LGR4Q9BXB1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LGR4Q9BXB1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LGR4Q9BXB1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LGR4Q9BXB1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LGR4Q9BXB1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LGR4Q9BXB1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LGR4Q9BXB1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LGR4Q9BXB1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LGR4Q9BXB1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LGR4Q9BXB1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LGR4Q9BXB1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGR4Q9BXB1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGR4Q9BXB1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGR4Q9BXB1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGR4Q9BXB1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGR4Q9BXB1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LGR4Q9BXB1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGR4Q9BXB1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGR4Q9BXB1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGR4Q9BXB1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGR4Q9BXB1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGR4Q9BXB1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LGR4Q9BXB1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGR4Q9BXB1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGR4Q9BXB1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGR4Q9BXB1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGR4Q9BXB1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LGR4Q9BXB1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LGR4Q9BXB1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LGR4Q9BXB1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LGR4Q9BXB1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LGR4Q9BXB1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LGR4Q9BXB1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LGR4Q9BXB1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LGR4Q9BXB1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LGR4Q9BXB1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGR4Q9BXB1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGR4Q9BXB1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGR4Q9BXB1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGR4Q9BXB1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGR4Q9BXB1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGR4Q9BXB1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGR4Q9BXB1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGR4Q9BXB1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGR4Q9BXB1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGR4Q9BXB1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR4Q9BXB1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR4Q9BXB1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR4Q9BXB1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR4Q9BXB1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR4Q9BXB1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LGR4Q9BXB1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LGR4Q9BXB1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGR4Q9BXB1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGR4Q9BXB1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGR4Q9BXB1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGR4Q9BXB1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGR4Q9BXB1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGR4Q9BXB1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGR4Q9BXB1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR4Q9BXB1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR4Q9BXB1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR4Q9BXB1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR4Q9BXB1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR4Q9BXB1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGR4Q9BXB1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGR4Q9BXB1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms