Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX73

TM2D2, TM2 domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D2Q9BX73 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM2D2Q9BX73 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM2D2Q9BX73 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM2D2Q9BX73 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM2D2Q9BX73 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM2D2Q9BX73 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM2D2Q9BX73 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM2D2Q9BX73 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM2D2Q9BX73 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM2D2Q9BX73 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM2D2Q9BX73 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM2D2Q9BX73 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM2D2Q9BX73 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM2D2Q9BX73 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM2D2Q9BX73 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM2D2Q9BX73 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TM2D2Q9BX73 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TM2D2Q9BX73 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TM2D2Q9BX73 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TM2D2Q9BX73 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms