Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC11Q9BVV2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC11Q9BVV2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms