Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP58Q9BVL2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP58Q9BVL2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUP58Q9BVL2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUP58Q9BVL2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP58Q9BVL2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP58Q9BVL2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP58Q9BVL2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP58Q9BVL2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP58Q9BVL2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP58Q9BVL2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP58Q9BVL2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP58Q9BVL2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP58Q9BVL2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP58Q9BVL2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP58Q9BVL2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP58Q9BVL2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP58Q9BVL2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP58Q9BVL2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP58Q9BVL2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP58Q9BVL2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP58Q9BVL2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP58Q9BVL2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP58Q9BVL2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP58Q9BVL2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP58Q9BVL2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP58Q9BVL2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP58Q9BVL2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP58Q9BVL2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP58Q9BVL2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP58Q9BVL2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NUP58Q9BVL2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUP58Q9BVL2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUP58Q9BVL2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUP58Q9BVL2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUP58Q9BVL2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUP58Q9BVL2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUP58Q9BVL2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUP58Q9BVL2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUP58Q9BVL2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUP58Q9BVL2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUP58Q9BVL2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUP58Q9BVL2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP58Q9BVL2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP58Q9BVL2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP58Q9BVL2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP58Q9BVL2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP58Q9BVL2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP58Q9BVL2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP58Q9BVL2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP58Q9BVL2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP58Q9BVL2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP58Q9BVL2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP58Q9BVL2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP58Q9BVL2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP58Q9BVL2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms