Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNPPD1Q9BV87 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNPPD1Q9BV87 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNPPD1Q9BV87 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNPPD1Q9BV87 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CNPPD1Q9BV87 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CNPPD1Q9BV87 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNPPD1Q9BV87 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNPPD1Q9BV87 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNPPD1Q9BV87 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNPPD1Q9BV87 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CNPPD1Q9BV87 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNPPD1Q9BV87 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNPPD1Q9BV87 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNPPD1Q9BV87 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNPPD1Q9BV87 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNPPD1Q9BV87 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNPPD1Q9BV87 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNPPD1Q9BV87 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNPPD1Q9BV87 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNPPD1Q9BV87 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNPPD1Q9BV87 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNPPD1Q9BV87 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNPPD1Q9BV87 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNPPD1Q9BV87 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CNPPD1Q9BV87 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNPPD1Q9BV87 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNPPD1Q9BV87 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CNPPD1Q9BV87 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNPPD1Q9BV87 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNPPD1Q9BV87 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNPPD1Q9BV87 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNPPD1Q9BV87 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNPPD1Q9BV87 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNPPD1Q9BV87 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNPPD1Q9BV87 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNPPD1Q9BV87 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNPPD1Q9BV87 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNPPD1Q9BV87 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNPPD1Q9BV87 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNPPD1Q9BV87 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNPPD1Q9BV87 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNPPD1Q9BV87 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNPPD1Q9BV87 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNPPD1Q9BV87 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNPPD1Q9BV87 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNPPD1Q9BV87 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNPPD1Q9BV87 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CNPPD1Q9BV87 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNPPD1Q9BV87 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CNPPD1Q9BV87 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNPPD1Q9BV87 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNPPD1Q9BV87 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNPPD1Q9BV87 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNPPD1Q9BV87 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNPPD1Q9BV87 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNPPD1Q9BV87 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNPPD1Q9BV87 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNPPD1Q9BV87 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNPPD1Q9BV87 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CNPPD1Q9BV87 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNPPD1Q9BV87 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNPPD1Q9BV87 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms