Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB6Q9BUF5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB6Q9BUF5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB6Q9BUF5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB6Q9BUF5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB6Q9BUF5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB6Q9BUF5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB6Q9BUF5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB6Q9BUF5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB6Q9BUF5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB6Q9BUF5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB6Q9BUF5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB6Q9BUF5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB6Q9BUF5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB6Q9BUF5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB6Q9BUF5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB6Q9BUF5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB6Q9BUF5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB6Q9BUF5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB6Q9BUF5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB6Q9BUF5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB6Q9BUF5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB6Q9BUF5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TUBB6Q9BUF5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB6Q9BUF5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB6Q9BUF5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB6Q9BUF5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB6Q9BUF5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB6Q9BUF5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB6Q9BUF5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB6Q9BUF5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB6Q9BUF5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB6Q9BUF5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB6Q9BUF5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB6Q9BUF5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB6Q9BUF5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB6Q9BUF5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB6Q9BUF5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB6Q9BUF5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB6Q9BUF5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB6Q9BUF5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB6Q9BUF5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB6Q9BUF5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms