Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRACR2AQ9BSW2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRACR2AQ9BSW2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRACR2AQ9BSW2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRACR2AQ9BSW2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRACR2AQ9BSW2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CRACR2AQ9BSW2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRACR2AQ9BSW2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRACR2AQ9BSW2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRACR2AQ9BSW2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRACR2AQ9BSW2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRACR2AQ9BSW2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRACR2AQ9BSW2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRACR2AQ9BSW2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRACR2AQ9BSW2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRACR2AQ9BSW2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRACR2AQ9BSW2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CRACR2AQ9BSW2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CRACR2AQ9BSW2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRACR2AQ9BSW2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRACR2AQ9BSW2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRACR2AQ9BSW2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRACR2AQ9BSW2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRACR2AQ9BSW2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRACR2AQ9BSW2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRACR2AQ9BSW2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRACR2AQ9BSW2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRACR2AQ9BSW2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRACR2AQ9BSW2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRACR2AQ9BSW2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CRACR2AQ9BSW2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CRACR2AQ9BSW2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRACR2AQ9BSW2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRACR2AQ9BSW2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRACR2AQ9BSW2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRACR2AQ9BSW2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRACR2AQ9BSW2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CRACR2AQ9BSW2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRACR2AQ9BSW2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRACR2AQ9BSW2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRACR2AQ9BSW2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRACR2AQ9BSW2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRACR2AQ9BSW2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRACR2AQ9BSW2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRACR2AQ9BSW2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRACR2AQ9BSW2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CRACR2AQ9BSW2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CRACR2AQ9BSW2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRACR2AQ9BSW2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRACR2AQ9BSW2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRACR2AQ9BSW2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CRACR2AQ9BSW2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRACR2AQ9BSW2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRACR2AQ9BSW2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRACR2AQ9BSW2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRACR2AQ9BSW2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRACR2AQ9BSW2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRACR2AQ9BSW2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRACR2AQ9BSW2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRACR2AQ9BSW2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRACR2AQ9BSW2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRACR2AQ9BSW2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRACR2AQ9BSW2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRACR2AQ9BSW2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRACR2AQ9BSW2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRACR2AQ9BSW2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRACR2AQ9BSW2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRACR2AQ9BSW2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms