Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP2Q99959 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP2Q99959 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP2Q99959 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP2Q99959 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP2Q99959 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP2Q99959 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP2Q99959 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP2Q99959 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP2Q99959 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP2Q99959 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP2Q99959 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP2Q99959 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP2Q99959 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP2Q99959 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP2Q99959 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP2Q99959 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP2Q99959 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP2Q99959 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP2Q99959 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP2Q99959 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP2Q99959 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP2Q99959 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PKP2Q99959 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms